Az elmúlt két évtizedben a technológia jelentős fejlődése és az új módszerek a proteomikát rendkívül hatékony eszközzé tették a fehérjékkel foglalkozó tudósok, biológusok és klinikai kutatók számára.
A timsTOF Pro bevezetése óta a forradalmi PASEF® spektrumfelvételi móddal párosulva nemcsak a sebesség, az érzékenység, a szelektivitás és a robusztusság terén nyit új határokat, hanem lehetővé teszi a 4D-Proteomics™ megközelítéseket is, lehetővé téve a tudósok számára a proteom korábban nem hozzáférhető részeinek rutinszerű feltárását.
PASEF® (Parallel Accumulation Serial Fragmentation) stratégia a timsTOF sorozat készülékeiben, ahol az ionok felhalmozódnak, miközben a második TIMS régió sorozatosan eluálja a peptideket.
A PASEF® spektrumfelvételi mód során koncentrált ioncsomagok eluálódnak ki az ionmobilitási cellából 2-5 ms alatt, mellyel elérhető a >100 Hz-es MS/MS spektrumfelvételi sebesség és a 100%-ot megközelítő munkaciklus.
Ezzel a sebesség és az érzékenység növekedése mellett kiemelkedő elválasztás érhető el, miközben a TOF analizátor lehetővé teszi az ultramagas MS/MS felbontás fenntartását bármely MS és MS/MS sebesség mellett.
A szövetekből vagy biofolyadékokból történő közvetlen fehérjeelemzés számos analitikai kihívást vet fel.
A fehérjeexpresszió az egyén genetikai hátterétől függően, de időben, lokalizációban és külső ingerekre (stressz, betegség, öregedés, fizikai erőfeszítés, …) adott fiziológiai válaszként is változik. Továbbá, az alternatív splicing, a pontmutáció, a poszttranszlációs módosítások és az endogén proteolízis együttes hatása miatt egy adott fehérje (génexpressziós termék) számos különböző proteoformaként fejeződhet ki, amelyek mindegyike saját biológiai aktivitással rendelkezik.
Ennek a komplexitásnak a teljes körű kezelése csak ortogonális megközelítésekkel érhető el. A Bruker ezeknek kihívásoknak a kezelésére megoldások dedikált paneljét kínálja.
